Os scripts Cgi / Perl precisam de permissões especificas para que funcionem corretamente. Sempre fique atento e verifique se as permissões estão corretas para o script de acordo com o desenvolvedor do mesmo. A permissão mais comum é 755 . Erros de permissão resultarão diversos erros como por exemplo: INTERNAL SERVER ERROR.
Você pode acertar as permissões de seu script da seguinte forma:
CHMOD 755
Entre em seu CPANEL e clique Administrador de Arquivos.
Procure pelos arquivos e pastas nos quais você está identificando o erro.
No frame da direita que se abrirá a cada seleção de arquivo ou pasta selecione a opção Change Permissions.
Selecione todos os quadros dessa opção até que se obtenha o valor 777.
Obs.: Você também pode configurar as permissões utilizando o seu FTP. Para isso só precisa clicar com o botão direito do mouse nos arquivos e pastas listados acima